"Вы должны получить направление в приемной комиссии для прохождения медкомиссии на профпригодность. Для этого при себе необходимо иметь: паспорт, фото, медицинские справки."

про паспортное фото имеется в виду?
и какие именно нужны справки?

Фотографии 3x4, прихватите с собой амбулаторную карту. В приемной комиссии вам выдадут направление в больницу и всё объяснят. После больницы, вам дадут справку о годности, её необходимо будет принести в приемную комиссию.

а флюрография и всё прочее там же в железнодорожной поликлинике проводится?

Да

чем отличаются графики работы машинистов и их помощников товарных, пассажирских поездов и электричек?

График работы на электричках более стабилен, т.к. движутся по расписанию - строгому;
Так же на пассажирских поездах график более стабилен. А вот на грузовых, товарных - диспетчера ставят по приоритету. На ТЭиБД вы это разберете )))